В Письме от 14 февраля 2019 г. N 03-07-09/9057 Министерство финансов России ответило на вопрос о возможности принятия НДС к вычету по дубликату счета-фактуры. Ответ Минфина категоричен – нет. Ссылаясь на то, что в гл. 21 НК РФ нет понятия «дубликат», ведомство отказывает налогоплательщикам в этом праве.
Отметим, что суды придерживаются иного мнения. Так, есть судебная практика, согласно которой вычет по дубликату счета-фактуры правомерен, если соблюдены другие условия для вычета НДС (Постановления ФАС Центрального округа от 01.06.2016 N Ф10-1645/2016, ФАС Поволжского округа от 05.05.2014 N А12-16582/2013, ФАС Московского округа от 25.05.2012 N А40-110048/10-140-598).
На практике, если налогоплательщик утратил счет-фактуру, контрагенты идут ему на встречу и дают второй (хоть пятый) экземпляр, так как для этого достаточно его напечатать и подписать у руководителя.
Сложности возникают только тогда, когда в момент обращения у контрагента сменился руководитель, и подписать документ можно только действующей подписью.