В своем Письме от 02.08.2019 № 03-07-11/58375 Минфин разъяснил, правомерно ли заявлять вычет, если в счете-фактуре указана неправильная ставка НДС.

Ведомство указало на то, что неправильно указанная ставка препятствует налоговым органам при проведении налоговой проверки идентифицировать налоговую ставку и сумму налога, предъявленную покупателю. Соответственно такая ошибка будет являться основанием для отказа в принятии к вычету сумм налога (абз. 2 п. 2 ст. 169 НК РФ).

Данные разъяснения касались ошибки в связи с повышением ставки НДС в 2019 году с 18% до 20%, однако такой подход Минфина можно распространить и на другие ситуации, когда в счет-фактуре указана неверная ставка.